background

Ressources

• Alphamissense – Base de données faux-sens

• ARResT/AssignSubsets – Outils pour la classification des LLC

• Catalogue Of Somatic Mutations In Cancer (COSMIC)

• cBioPortal – Données des programmes de séquençage

• ClinVar – Rechercher des données sur un variant connu

• gnomAD browser – Base de données WES/WGS (pathologies et population générale)

• Human Splicing Finder – Interpréter un variant de splice potentiel

• ICGC Data Portal – Données de whole genome

• International Agency for Research on Cancer (IARC) TP53 Data Base – Base de données des variants de p53

• PolyPhen-2 – Interpréter une mutation ponctuelle faux sens

• Sequence Variant Nomenclature – Annoter un variant

• SPiP – Outils pour les sites d’épissage

• The international ImMunoGeneTics information system® (IMGT) – Base de données immunogénétique

• The Variant Interpretation for Cancer Consortium (VICC) Meta-Knowledgebase

• Tumor Fusion Gene Data Portal – Base de données de transcrits de fusion associés aux différents cancers

• Varsome – Interpréter un variant “inconnu” selon les règles ACMG

• StatAid – Logiciel statistique gratuit pour l’analyse des données appliquées aux sciences de la vie

• Ensembl – Genome Browser

• Bioplex Interactome – Base d’interactions protéiques

• BloodSpot – Base de données d’expression génique dans l’hématopoïèse

• ClinicalTrials.gov – Rechercher un essai clinique

• Depmap portal – Base de données d’effets de shRNA dans des lignées cellulaires

• Genomics of Drug Sensitivity in Cancer – Base de données pharmacogénomique sur lignées cellulaires

• GTEx Portal – Données d’expression tissulaire des gènes, transcrits

• My Cancer Genome® – Rechercher des informations sur une maladie tumorale, des essais cliniques, des thérapeutiques, une mutation, …

Proposer une ressource

ADRESSE

GBMHM – UG0299
1 avenue Claude Vellefaux
75010 PARIS

Contact Association

contact-asso@gbmhm.fr

Contact Plateforme d’EEQ

contact-eeq@gbmhm.fr

Mentions légales

Lien